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この時期、社会人野球の企業チームの撤退が相次いでいた。高校、大学を卒業した選手が、野球を続ける機会が減少しつつある。石毛氏が独立リーグを立ち上げた背景には、そうした日本野球に対する危機感もあった。
2005年2月、「四国アイランドリーグ」のユニホームがお披露目された。左から徳島インディゴソックス、香川オリーブガイナーズ、石毛宏典IBLJ代表、愛媛マンダリンパイレーツ、高知ファイティングドッグス（写真：共同通信社）拡大画像表示
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四国アイランドリーグに続く新リーグ設立の波
2005年、徳島インディゴソックス、香川オリーブガイナーズ、愛媛マンダリンパイレーツ、高知ファイティングドッグスの4球団で四国アイランドリーグは開幕したが、わずか数か月でリーグの運営は行き詰まった。運転資金が底をついたのだ。そこで、石毛氏らリーグ経営陣はスポンサー企業の支援を仰いでリーグを存続させた。
リーグ運営はスポンサー企業の経営者だった鍵山誠氏が引き継ぐこととなった。
2007年には、電通東日本の敏腕営業マンだった村山哲二氏が、Jリーグアルビレックス新潟のプロモーションを手掛けたのがきっかけとなって、スポーツビジネスに関わり、電通を退社してベースボール・チャレンジ・リーグ（BCリーグ）を設立した。
1年目のリーグ名は北信越ベースボール・チャレンジ・リーグ。新潟アルビレックスベースボールクラブ、信濃グランセローズ、富山サンダーバーズ、石川ミリオンスターズの4球団でスタートした。
さらに2009年には紀州レンジャーズ、明石レッドソルジャーズ、大阪ゴールドビリケーンズ、神戸9クルーズの4球団で関西独立リーグが、スタートした。
